203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4827 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 285 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  61.8 
 
 		 286 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  61.8 
 
 		 286 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  61.8 
 
 		 286 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  58.95 
 
 		 287 aa  353  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  57.19 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  57.19 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  57.19 
 
 		 289 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  58.36 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  58.36 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  57.99 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  57.99 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  57.99 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  56.14 
 
 		 289 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  54.74 
 
 		 289 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  54.39 
 
 		 289 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  55.44 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  57.95 
 
 		 288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  55.72 
 
 		 286 aa  339  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  56.88 
 
 		 286 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  56.83 
 
 		 289 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  55.48 
 
 		 286 aa  333  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  57.41 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  56.46 
 
 		 289 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  56.09 
 
 		 289 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  56.46 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  57.95 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  57.95 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  57.95 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  57.95 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  57.95 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  57.95 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  57.6 
 
 		 288 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  57.25 
 
 		 286 aa  328  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  57.03 
 
 		 287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  55.35 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  55.34 
 
 		 286 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  55.12 
 
 		 287 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  56.54 
 
 		 288 aa  322  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  56.54 
 
 		 288 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  55.73 
 
 		 286 aa  321  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  55.09 
 
 		 288 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  56.39 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  56.44 
 
 		 287 aa  319  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  56.44 
 
 		 287 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  53.5 
 
 		 290 aa  318  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  56.44 
 
 		 287 aa  318  9e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  54.06 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  53.36 
 
 		 288 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  53.76 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  49.48 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  48.75 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  49.82 
 
 		 294 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  48.75 
 
 		 296 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  49.64 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  51.05 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  49.65 
 
 		 303 aa  285  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  49.82 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  48.76 
 
 		 311 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  48.76 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  49.47 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  48.41 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  48.58 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  47.39 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  46.26 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  45.45 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  49.82 
 
 		 289 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  51.42 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01959  Acyl-CoA thioesterase II  51.64 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000306387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  45.91 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  45.61 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  45.94 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  45.26 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  48.06 
 
 		 268 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  45.1 
 
 		 286 aa  262  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  47.87 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  44.06 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  45.45 
 
 		 293 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  45.1 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  44.76 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  44.76 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  47.31 
 
 		 314 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  45.83 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  44.56 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  46.64 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  45.71 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  48.76 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  46.42 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  44.4 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  44.69 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  44.37 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>