More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4818 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  100 
 
 		 422 aa  855    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  42.25 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 422 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  37.17 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1843  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 429 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0463  histidine kinase  38.46 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3530  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 429 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3708  ATPase domain-containing protein  37.95 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 434 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0601  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.45 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 417 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  29.1 
 
 		 426 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 423 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  29.72 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  29.35 
 
 		 422 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  30.84 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  27.17 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 430 aa  146  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  27.08 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 418 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.64 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3369  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  25.07 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  25.85 
 
 		 442 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 476 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 476 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 468 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  28.68 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  23.7 
 
 		 450 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  24.47 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 437 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  25.24 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  24.36 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  26.2 
 
 		 405 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  25.57 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  27.03 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  26.08 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  25.87 
 
 		 442 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  24.24 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  24.22 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  25 
 
 		 463 aa  97.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  24.34 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 466 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>