More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4758 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  454  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  57.63 
 
 
237 aa  231  8e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  50.53 
 
 
329 aa  198  4e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  53.76 
 
 
247 aa  193  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  48.99 
 
 
245 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  50.8 
 
 
239 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  50.8 
 
 
239 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  50.8 
 
 
239 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.02 
 
 
239 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  52.6 
 
 
251 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  52.6 
 
 
251 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  52.6 
 
 
251 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  52.02 
 
 
299 aa  188  6e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  52.02 
 
 
249 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  50.87 
 
 
226 aa  184  1e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  49.43 
 
 
243 aa  183  1e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  49.72 
 
 
326 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  48.91 
 
 
304 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  44.51 
 
 
328 aa  164  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.08 
 
 
297 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  44.81 
 
 
297 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  44.15 
 
 
202 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 
218 aa  148  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  44.77 
 
 
216 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 
198 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  61.61 
 
 
196 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  58.04 
 
 
261 aa  139  2e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  41.84 
 
 
204 aa  139  2e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  61.61 
 
 
207 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  42.35 
 
 
204 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  46.47 
 
 
212 aa  139  4e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.41 
 
 
203 aa  138  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  52.03 
 
 
217 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  57.14 
 
 
283 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.47 
 
 
206 aa  136  3e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  54.47 
 
 
189 aa  134  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.16 
 
 
188 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  56.36 
 
 
258 aa  130  1e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  51.69 
 
 
174 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  51.26 
 
 
235 aa  126  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  52.34 
 
 
191 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  47.55 
 
 
300 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  48.28 
 
 
261 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  54.72 
 
 
199 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  43.58 
 
 
216 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 
281 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.00876e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  48.28 
 
 
261 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.65036e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  48.28 
 
 
261 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  43.58 
 
 
221 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  47.41 
 
 
263 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  47.41 
 
 
259 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  39.27 
 
 
208 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  47.41 
 
 
261 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  47.41 
 
 
261 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  47.41 
 
 
261 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  47.41 
 
 
261 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  47.41 
 
 
261 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  54.31 
 
 
293 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  47.41 
 
 
261 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 
271 aa  120  1e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
244 aa  120  1e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 
305 aa  119  2e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 
272 aa  120  2e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  47.32 
 
 
206 aa  120  2e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  50.89 
 
 
280 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
233 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  53.57 
 
 
217 aa  119  4e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  52.99 
 
 
204 aa  119  4e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 
211 aa  118  5e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
299 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  54.92 
 
 
285 aa  118  8e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  32.52 
 
 
273 aa  117  1e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  53.21 
 
 
234 aa  117  1e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  48.28 
 
 
146 aa  117  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  45.69 
 
 
238 aa  116  2e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.77614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  54.92 
 
 
296 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 
208 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  53.57 
 
 
260 aa  115  4e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 
291 aa  115  4e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  54.1 
 
 
296 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  53.1 
 
 
296 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  52.68 
 
 
260 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  53.1 
 
 
296 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  47.46 
 
 
197 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  52.21 
 
 
194 aa  115  7e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  47.46 
 
 
218 aa  114  8e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  47.46 
 
 
197 aa  114  8e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
228 aa  114  1e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 
224 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  51.33 
 
 
200 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 
332 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 
202 aa  112  4e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  39.05 
 
 
199 aa  112  4e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  47.5 
 
 
242 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  47.33 
 
 
258 aa  111  7e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
327 aa  111  8e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  44.37 
 
 
271 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 
222 aa  110  2e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.72 
 
 
318 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  50 
 
 
241 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>