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for query gene CPS_4749 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  433  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  52.94 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  48.47 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  44.72 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  49.16 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  45.5 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  44.44 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  42.48 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  34.38 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  31.21 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.85 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  24.85 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  34.71 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  26.88 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4845  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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