35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4714 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  100 
 
 		 882 aa  1778    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1104 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1100 aa  102  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  31.71 
 
 		 863 aa  98.2  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1307 aa  95.9  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1086 aa  88.2  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1205 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1148 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  32.57 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1164 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1058 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1066 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1154 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1222 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1108 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1070 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1068 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  32.74 
 
 		 712 aa  81.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  35.66 
 
 		 888 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  32.14 
 
 		 707 aa  78.2  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  32.89 
 
 		 891 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  25.75 
 
 		 863 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  25 
 
 		 854 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  21.38 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  28.32 
 
 		 857 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  24.53 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  29.07 
 
 		 860 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  34 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  26.79 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1134 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  25 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  25 
 
 		 863 aa  54.7  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  24.49 
 
 		 633 aa  51.6  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1943  hypothetical protein  23.83 
 
 		 879 aa  47.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00013464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>