More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4695 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4695  response regulator  100 
 
 		 519 aa  1051    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1038  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 380 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0985  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.758318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0905  response regulator receiver protein  25.73 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  33.58 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 779 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  33.86 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  28.8 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 926 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  27.86 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.4 
 
 		 768 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 146 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  29.45 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  32.8 
 
 		 135 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  32.8 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 529 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  29.91 
 
 		 143 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  29.6 
 
 		 135 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  28 
 
 		 146 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  32 
 
 		 135 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  19.57 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 773 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2343  response regulator receiver  21.56 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0221  histidine kinase  27.13 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 647 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 126 aa  65.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3054  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.61 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 133 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 662 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 873 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.23 
 
 		 873 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.83 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  29.63 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 		 890 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  27.34 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.23 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 819 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1397 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 898 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 		 133 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.19 
 
 		 310 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1271 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0400  response regulator receiver protein  22.18 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.401585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  30.4 
 
 		 145 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  32.56 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.43 
 
 		 819 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  24 
 
 		 1240 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.78 
 
 		 962 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  27.59 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 877 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 957 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  24.68 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.17 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  29.92 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  28.81 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  32.2 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.15 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  26.12 
 
 		 2035 aa  60.8  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 778 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.94 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  27.92 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.57 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  31.53 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  28.36 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>