262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4652 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3790  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0097  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0098  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.266439  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0118  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0573912  normal  0.387892 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4158  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0029  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00062  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0002  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3956  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0473584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3912  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3834  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0179595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3866  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4705  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5079  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0002  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4915  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4016  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0001  tRNA-Pro  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.170167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3847  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.779981  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0031  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0059  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0028  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0071  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0024  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.158579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0041  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0248017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0040  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0097  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000321345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0057  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0107433  normal  0.396712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0051  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000340535  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0097  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.96402 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0035  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.928344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0058  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387879  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0031  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0036  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309277  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.203232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0534  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0093  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00070  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000213346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0104  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000101126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4160  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4160  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4145  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000725201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0006  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000337222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0050  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0045  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0152131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0002  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4713  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.43285e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4263  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000112218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5235  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000789982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0528  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000899305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0002  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.236408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0121  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000547539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4202  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.22322e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0034  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1407  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4295  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5090  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5233  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4129  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17442  normal  0.148505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0002  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>