271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4417 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 830 aa  1668    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.01 
 
 		 823 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.55 
 
 		 862 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  22.16 
 
 		 796 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.83 
 
 		 817 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  21.56 
 
 		 805 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 		 813 aa  127  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.3 
 
 		 882 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  23.84 
 
 		 816 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.45 
 
 		 821 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.51 
 
 		 817 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22 
 
 		 805 aa  111  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.18 
 
 		 807 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.97 
 
 		 822 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.47 
 
 		 813 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.4 
 
 		 893 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  21.64 
 
 		 831 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  22.29 
 
 		 845 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  22.16 
 
 		 869 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  22.53 
 
 		 809 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  22.3 
 
 		 802 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  21.64 
 
 		 797 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.19 
 
 		 812 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  21.42 
 
 		 814 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  21.71 
 
 		 807 aa  104  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  22.56 
 
 		 887 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  22.24 
 
 		 801 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  22.95 
 
 		 803 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.87 
 
 		 805 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  23 
 
 		 800 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  23.78 
 
 		 843 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.5 
 
 		 879 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  22.61 
 
 		 798 aa  99.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  22.16 
 
 		 804 aa  100  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.86 
 
 		 884 aa  99  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  21.57 
 
 		 808 aa  98.2  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.49 
 
 		 816 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  20.73 
 
 		 821 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.17 
 
 		 805 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  22.31 
 
 		 803 aa  94  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.82 
 
 		 810 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  23.64 
 
 		 861 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  19.79 
 
 		 805 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  21.87 
 
 		 805 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  21.82 
 
 		 887 aa  91.3  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.91 
 
 		 809 aa  90.9  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.03 
 
 		 807 aa  90.9  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  20.58 
 
 		 803 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.75 
 
 		 913 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  23.85 
 
 		 808 aa  88.2  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.43 
 
 		 878 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.32 
 
 		 844 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  21.21 
 
 		 809 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  20.87 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  23.4 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.53 
 
 		 874 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.27 
 
 		 849 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  22.78 
 
 		 848 aa  84.7  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  22.57 
 
 		 817 aa  84.7  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.57 
 
 		 828 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.09 
 
 		 871 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  21.15 
 
 		 798 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  21.91 
 
 		 844 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  22.02 
 
 		 793 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.11 
 
 		 915 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.64 
 
 		 846 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  21.88 
 
 		 795 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  21.02 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.3 
 
 		 888 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  21.75 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  21.92 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  20.69 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  22 
 
 		 797 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.24 
 
 		 820 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  21.84 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  27.89 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  21.33 
 
 		 865 aa  71.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  22.31 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  22.09 
 
 		 809 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  20.9 
 
 		 809 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  21.67 
 
 		 808 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.35 
 
 		 808 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  20.97 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  20.34 
 
 		 784 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.1 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  21.99 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  20.72 
 
 		 792 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.76 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  21.42 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.3 
 
 		 883 aa  67.8  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  24.09 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  22.72 
 
 		 807 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  21.28 
 
 		 789 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 		 792 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.93 
 
 		 880 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 		 802 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  22.67 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 805 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  20.18 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  19.3 
 
 		 811 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>