98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4371 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4371  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.854444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  36.54 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  33.65 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  33.65 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  36.73 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  34.78 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  33.7 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  37.61 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  35.05 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  36.26 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  37.63 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  37.63 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  35.96 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  35.79 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  36.56 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  33.71 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  35.79 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  35.35 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  35.35 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  37.36 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  31.31 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  35.35 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  35.35 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  33.65 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  35.48 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  33.68 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  31.73 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  31.15 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  30.93 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  31.73 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  31.73 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  31.18 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  31.73 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  29.59 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  32.11 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  32.58 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  31.18 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  30.83 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  36.67 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  35.48 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  29.75 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  31.43 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  28.57 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  29.67 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  26.79 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  31.31 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  31.09 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  33.71 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  28.85 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  31.73 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  30.83 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  29.29 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  26.17 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  28.26 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  30.56 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  26.17 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  30.58 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  30.19 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  27 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  29.09 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  28.18 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  29.09 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  31.31 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  24.3 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  31.4 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  26.09 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  32.22 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  30.19 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  28.42 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  26.53 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  29.09 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  28.12 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  28.1 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  31.37 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  25.81 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  30.28 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  28.3 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  28.71 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  29.35 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>