201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4236 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  51.09 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.59 
 
 		 926 aa  91.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  35.88 
 
 		 135 aa  91.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  37.69 
 
 		 135 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  36.15 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 927 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 529 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  38.71 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  35.29 
 
 		 158 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  40 
 
 		 143 aa  84.7  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 529 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 		 529 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  36.89 
 
 		 153 aa  84.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 529 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 529 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 		 526 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  34.35 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  40.16 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  35.11 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 1032 aa  81.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 722 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  33.07 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 518 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  33.09 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  35.16 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  34.56 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  36.15 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  37.1 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 779 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  37.1 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.96 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  33.58 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 135 aa  72  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  27.86 
 
 		 667 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  34.38 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  33.6 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 		 579 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 		 994 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 615 aa  69.7  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 518 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  30.95 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 963 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 515 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  31.06 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 131 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  25.62 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  24.6 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  27.92 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.25 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  26.92 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  31.75 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.93 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  30 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  32.79 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 		 963 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  27.61 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 941 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  30.4 
 
 		 142 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  36 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.73 
 
 		 1004 aa  61.6  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 997 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  29.2 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  29.85 
 
 		 871 aa  61.6  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  30.16 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.69 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.68 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.55 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  27.61 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  28.79 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  28.79 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 736 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  28.46 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>