More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4213 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  100 
 
 		 721 aa  1470    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  58.53 
 
 		 716 aa  862    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  60.09 
 
 		 710 aa  866    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  61.11 
 
 		 704 aa  877    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  66.99 
 
 		 724 aa  988    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  56.37 
 
 		 717 aa  832    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  54.16 
 
 		 713 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 783 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  36.43 
 
 		 817 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  33.14 
 
 		 771 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 849 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 723 aa  288  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 697 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 723 aa  280  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 723 aa  280  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 738 aa  279  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 700 aa  277  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 725 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 725 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 725 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 725 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  29.07 
 
 		 713 aa  267  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 718 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 704 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 723 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 701 aa  252  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 701 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 809 aa  231  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  27.22 
 
 		 813 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  27.4 
 
 		 816 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 843 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 758 aa  204  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 739 aa  203  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 753 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 709 aa  198  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 716 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 728 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  34.5 
 
 		 332 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 839 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  28.47 
 
 		 723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  25 
 
 		 812 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  26.42 
 
 		 714 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  26.53 
 
 		 732 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  25.56 
 
 		 733 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 751 aa  173  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 732 aa  173  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 746 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  27.79 
 
 		 723 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 726 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 726 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 726 aa  153  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 745 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 745 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 745 aa  153  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 742 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  25.59 
 
 		 755 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 698 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 808 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 808 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  22.7 
 
 		 817 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.32 
 
 		 755 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.96 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 722 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 727 aa  77.4  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 688 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 736 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.12 
 
 		 655 aa  73.9  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.81 
 
 		 688 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  27.8 
 
 		 739 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.1 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 634 aa  72.8  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 686 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.74 
 
 		 862 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 891 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.22 
 
 		 862 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.16 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.35 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.58 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.58 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.35 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.35 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.58 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.58 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.58 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.35 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.35 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.35 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.35 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  31.58 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.22 
 
 		 614 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.22 
 
 		 614 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.21 
 
 		 681 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 613 aa  70.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>