275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4205 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  100 
 
 
131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  70.77 
 
 
130 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  68.25 
 
 
132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  66.93 
 
 
131 aa  187  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  66.4 
 
 
131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  63.08 
 
 
130 aa  181  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  61.48 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  67.46 
 
 
129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
167 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.84 
 
 
185 aa  130  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.76 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  49.17 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
142 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
144 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
132 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  42.5 
 
 
451 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45 
 
 
151 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  44.35 
 
 
116 aa  107  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  41.8 
 
 
464 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  42.19 
 
 
146 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  43.8 
 
 
447 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
152 aa  92  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  39.67 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  39.06 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  35.38 
 
 
512 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  37.12 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  38.02 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4011  transketolase  53.23 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  35.16 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  34.33 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  32.52 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  37.4 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  36.09 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  38.46 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  31.75 
 
 
371 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  35.38 
 
 
491 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  35.04 
 
 
501 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  40 
 
 
487 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  34.38 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  34.33 
 
 
490 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  38.78 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  35.61 
 
 
472 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  32.09 
 
 
461 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0022  cytidyltransferase-like protein  30.71 
 
 
366 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.112935  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  34.62 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2338  rfaE bifunctional protein  32.09 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  35.87 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  39.58 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  36.17 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1591  cytidyltransferase-related domain protein  30.94 
 
 
363 aa  62  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  37.23 
 
 
487 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  33.08 
 
 
495 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  36.17 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2823  rfaE bifunctional protein  33.09 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  36.64 
 
 
490 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3605  bifunctional ADP-heptose synthase  31.34 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  35.48 
 
 
172 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  36.17 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  35.38 
 
 
472 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  33.7 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  36.17 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  33.7 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  32.82 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  29.23 
 
 
175 aa  60.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  34.09 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  30.6 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  35.79 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  31.25 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  34.74 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  34.38 
 
 
358 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  34.38 
 
 
358 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  35.79 
 
 
488 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.33 
 
 
481 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  34.09 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  38.14 
 
 
477 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  31.91 
 
 
490 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0597  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.06 
 
 
473 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2543  rfaE bifunctional protein  38.78 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  34.74 
 
 
490 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1184  rfaE bifunctional protein  32.56 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0571  rfaE bifunctional protein  31.82 
 
 
486 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.861357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1031  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
501 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  35.05 
 
 
458 aa  57  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  34.04 
 
 
488 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5731  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.54 
 
 
474 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  34.62 
 
 
468 aa  57  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1704  rfaE bifunctional protein  31.82 
 
 
479 aa  56.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  40 
 
 
455 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3773  rfaE bifunctional protein  36.84 
 
 
482 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889229  normal  0.588929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4715  rfaE bifunctional protein  35 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.328325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>