More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4135 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4135  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.931472  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1012  chromosome replication initiation inhibitor protein  64.43 
 
 		 298 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.76 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03558  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.94 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002477  chromosome initiation inhibitor  45.95 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.28 
 
 		 298 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.79 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.79 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.79 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.45 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3302  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.779303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3299  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3237  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3225  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0441076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3404  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.93 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269089  normal  0.216257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02747  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0777  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02710  hypothetical protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3074  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.093516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4212  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3336  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3243  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.361223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0794  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3052  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3684  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.26 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3334  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.197754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.05 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.17 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.44 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.8 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  37.68 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.43 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.43 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.65 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.3 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.07 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.34 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.3 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.72 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.95 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.14 
 
 		 301 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.85 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.82 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.18 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.52 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.18 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.8 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.8 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.8 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.46 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.82 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.82 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.37 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.8 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  40.83 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.12 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2670  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.37 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.73 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.87 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  37.33 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1745  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.63 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307823  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.91 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1009  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.21 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.77 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.33 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.66 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.56 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.92 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.92 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.92 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.79 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6516  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.47 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.56 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.27 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.98 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.98 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.49 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.88 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.2 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.56 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.78 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.56 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.53 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.11 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3530  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.19 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>