158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4095 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.76 
 
 		 241 aa  232  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.37 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.78 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.78 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.78 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.56 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.78 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.72 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.29 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.75 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.75 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.05 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.79 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.79 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.98 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.2 
 
 		 241 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.9 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.85 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.75 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  41.75 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.75 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.75 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.51 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  41.75 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  41.75 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.75 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.75 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.06 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.55 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.06 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.06 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.06 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.06 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.48 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.5 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.05 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.05 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.09 
 
 		 238 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.14 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  40.66 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  38.43 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.11 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.5 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  33.83 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  37.2 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  35.94 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.14 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.67 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  38.73 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  34.44 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  39.57 
 
 		 238 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  37.75 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.32 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  34.55 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  36.23 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  36.17 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.18 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.06 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  35.18 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.54 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.24 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.38 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.46 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.46 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.46 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  35.29 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  35.98 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.59 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  38.38 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.91 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  32.43 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.86 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  33.52 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  34.13 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.12 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  32.14 
 
 		 178 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  35.14 
 
 		 187 aa  85.5  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  25.81 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  31.98 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  25.69 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  25.69 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  26.15 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  25.69 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  25.84 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  27.1 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.02 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  24.02 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.92 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  26.67 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.64 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  22.82 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  21.78 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  26.34 
 
 		 361 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  25.24 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  25.97 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  23.53 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>