More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4030 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
365 aa  765    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  67.04 
 
 
366 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  67.32 
 
 
367 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  66.76 
 
 
366 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  65.3 
 
 
390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  67.04 
 
 
366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  67.04 
 
 
366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  65.03 
 
 
366 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  65.3 
 
 
368 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  64.95 
 
 
396 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  64.75 
 
 
366 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  64.21 
 
 
366 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  64.17 
 
 
368 aa  491  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  44.73 
 
 
355 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.72 
 
 
385 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.21 
 
 
386 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  45.43 
 
 
382 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.24 
 
 
380 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.73 
 
 
380 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  46.24 
 
 
381 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  45.79 
 
 
379 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.96 
 
 
380 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.96 
 
 
380 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.96 
 
 
380 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  45.96 
 
 
381 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  45.1 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.98 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.98 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  45.93 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.77 
 
 
382 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  44.5 
 
 
418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.98 
 
 
382 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.17 
 
 
414 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  43.98 
 
 
382 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.98 
 
 
382 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.25 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  44.13 
 
 
379 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  44.51 
 
 
362 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  43.45 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.24 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  41.76 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  41.96 
 
 
372 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  43.3 
 
 
364 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  42.05 
 
 
394 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.93 
 
 
375 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  42.74 
 
 
355 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.64 
 
 
375 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.6 
 
 
374 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  41.53 
 
 
353 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.03 
 
 
383 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  41.36 
 
 
381 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.42 
 
 
361 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.6 
 
 
363 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  41.51 
 
 
606 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  41.51 
 
 
606 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.11 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.39 
 
 
363 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.12 
 
 
367 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.65 
 
 
403 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.71 
 
 
388 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.81 
 
 
380 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  40 
 
 
371 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.64 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.81 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.59 
 
 
376 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.18 
 
 
406 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  35.99 
 
 
365 aa  248  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.53 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  38.97 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  39.09 
 
 
325 aa  229  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  34.08 
 
 
351 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  35.51 
 
 
585 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.95 
 
 
702 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.2 
 
 
625 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  33.14 
 
 
627 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.99 
 
 
342 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.81 
 
 
670 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.59 
 
 
669 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  33.04 
 
 
662 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  32.42 
 
 
597 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  32.95 
 
 
605 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.58 
 
 
688 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.47 
 
 
585 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  31.55 
 
 
605 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  29.76 
 
 
373 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.65 
 
 
335 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.35 
 
 
677 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.69 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.69 
 
 
356 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.38 
 
 
322 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.38 
 
 
322 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  30.38 
 
 
322 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.38 
 
 
322 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.38 
 
 
322 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  30.38 
 
 
322 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.47 
 
 
329 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.38 
 
 
322 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.38 
 
 
322 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.38 
 
 
322 aa  159  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.25 
 
 
322 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>