More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4003 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  100 
 
 		 307 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.37 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  39.5 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.37 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  37.72 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  35.74 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  38.95 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  41.92 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  34.95 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  36.14 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  36.2 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  38.36 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.28 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  37.63 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  39.22 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  35.02 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  35.89 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  33.81 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  35.36 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.17 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  34.17 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.47 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  34.07 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  34.88 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  35.62 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  36.27 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  35.34 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  33.45 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  32.99 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  33.68 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  33.91 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  35.19 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  30.71 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  32.39 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  32.51 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  30.71 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  30.71 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  34.81 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  33.7 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  32.61 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  30.18 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  29.22 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  27.76 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  32.61 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  30.47 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  30.69 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  34.3 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  30.04 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  33.21 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  28.77 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  23.83 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  33.69 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  33.21 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  31.29 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  31.29 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  27.6 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  31.29 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  34.4 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  34.4 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  28.42 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  26.6 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  27.93 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  30.94 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  31.34 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  31.88 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.66 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  25.27 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.16 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  29.89 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  26.84 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  25.99 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  30.22 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  25.98 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  28.29 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  28.29 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  28.29 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26.12 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  26.43 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  27.4 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  29.33 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>