More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3984 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  39.43 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  33.72 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  34.72 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  33.07 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  34.67 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.5 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.16 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  29.32 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  32.34 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  32.49 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.67 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.08 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  37.11 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  37.11 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  26.58 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  26.58 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  31.3 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.41 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  34.62 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.84 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  31.79 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.08 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 333 aa  72  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 		 434 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.5 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  30.28 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  31.08 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  32.46 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  35.64 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  32.71 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  32.87 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  34.62 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  32.87 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  32.87 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  32.71 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.62 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  28.99 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.97 
 
 		 670 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  32.71 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  35.29 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 		 490 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  32.23 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  32.87 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.05 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  32.23 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  36.47 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  28.87 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  30.43 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  33.54 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  31.13 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  30.07 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.95 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  32.74 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  30.43 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  30 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  30.43 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 1026 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  33.61 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  34.71 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>