173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3960 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 776 aa  1606    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  42.8 
 
 		 795 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.71 
 
 		 762 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.33 
 
 		 795 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.58 
 
 		 775 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.61 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.91 
 
 		 772 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.15 
 
 		 779 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.84 
 
 		 634 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.8 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.02 
 
 		 905 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.42 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.19 
 
 		 609 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.72 
 
 		 774 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.51 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.74 
 
 		 790 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.32 
 
 		 533 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.28 
 
 		 526 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  41.08 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.73 
 
 		 618 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 		 766 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.56 
 
 		 613 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.97 
 
 		 785 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  34.29 
 
 		 777 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.28 
 
 		 781 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.95 
 
 		 605 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.32 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.6 
 
 		 812 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.4 
 
 		 812 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.87 
 
 		 821 aa  363  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.21 
 
 		 546 aa  363  8e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.3 
 
 		 765 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.18 
 
 		 779 aa  350  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.48 
 
 		 534 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.75 
 
 		 834 aa  347  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.37 
 
 		 527 aa  346  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 		 534 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.5 
 
 		 505 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.04 
 
 		 760 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.09 
 
 		 614 aa  324  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 637 aa  320  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.41 
 
 		 549 aa  309  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  37.01 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.64 
 
 		 469 aa  300  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  34.6 
 
 		 639 aa  297  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  35.48 
 
 		 602 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.83 
 
 		 639 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.41 
 
 		 545 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 		 525 aa  280  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.44 
 
 		 636 aa  277  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.39 
 
 		 481 aa  275  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  35.67 
 
 		 639 aa  273  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.4 
 
 		 688 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.62 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.12 
 
 		 529 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.34 
 
 		 683 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.83 
 
 		 665 aa  265  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 		 593 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.64 
 
 		 584 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.87 
 
 		 627 aa  259  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.13 
 
 		 558 aa  257  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.78 
 
 		 628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.49 
 
 		 447 aa  253  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.09 
 
 		 639 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.34 
 
 		 816 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.1 
 
 		 515 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.67 
 
 		 547 aa  247  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 		 549 aa  247  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.02 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.77 
 
 		 422 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.05 
 
 		 688 aa  240  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.36 
 
 		 525 aa  239  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.69 
 
 		 811 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.54 
 
 		 673 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.89 
 
 		 794 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.24 
 
 		 858 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.87 
 
 		 673 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.12 
 
 		 797 aa  216  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  29.31 
 
 		 1140 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.36 
 
 		 533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.71 
 
 		 676 aa  211  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.11 
 
 		 820 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.83 
 
 		 504 aa  207  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.55 
 
 		 807 aa  204  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.9 
 
 		 778 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.67 
 
 		 493 aa  197  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.37 
 
 		 863 aa  190  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.53 
 
 		 866 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.75 
 
 		 852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.92 
 
 		 868 aa  183  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 		 518 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.5 
 
 		 913 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.85 
 
 		 910 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 		 489 aa  171  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.72 
 
 		 530 aa  170  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  26.51 
 
 		 889 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.48 
 
 		 913 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 		 915 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.84 
 
 		 857 aa  165  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>