More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3953 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
381 aa  789    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.5 
 
 
373 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.5 
 
 
373 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.43 
 
 
373 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.22 
 
 
373 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.89 
 
 
373 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  53.13 
 
 
375 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.89 
 
 
373 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  53.13 
 
 
375 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
375 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.32 
 
 
373 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.59 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.04 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.32 
 
 
373 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.32 
 
 
373 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.77 
 
 
373 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.49 
 
 
384 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50.81 
 
 
373 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.43 
 
 
373 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.32 
 
 
373 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.76 
 
 
372 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.04 
 
 
375 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.45 
 
 
375 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50 
 
 
384 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
383 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
383 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.46 
 
 
379 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
379 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.32 
 
 
374 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.73 
 
 
379 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.73 
 
 
379 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
384 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
383 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
383 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.73 
 
 
379 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
379 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.46 
 
 
379 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48.66 
 
 
379 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.22 
 
 
383 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.46 
 
 
384 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  39.67 
 
 
706 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  29.66 
 
 
371 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 
274 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  35.41 
 
 
276 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  36.33 
 
 
288 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  35.1 
 
 
283 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  33.59 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
505 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  31.14 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 
443 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 
447 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  30.26 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  28.04 
 
 
437 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 
443 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  27.45 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  32.6 
 
 
242 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
288 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  29.67 
 
 
258 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  24.27 
 
 
375 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  22.41 
 
 
351 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  26.56 
 
 
292 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  28.76 
 
 
259 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  25 
 
 
263 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  23.66 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  22.18 
 
 
294 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  25 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  28.38 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.62 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  25.9 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  25 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  23.85 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  24.77 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  24.58 
 
 
333 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  23.46 
 
 
287 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.61 
 
 
301 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  22.94 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  23.87 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  40 
 
 
115 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  26.17 
 
 
285 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.36 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  44.44 
 
 
107 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.61 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  40 
 
 
115 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.93 
 
 
321 aa  58.9  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  40 
 
 
115 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  44.59 
 
 
110 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.09 
 
 
659 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.67 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>