More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3909 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3909  serine protease  100 
 
 
1042 aa  2128    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  35.77 
 
 
983 aa  465  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  34.32 
 
 
1312 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  34.73 
 
 
1006 aa  333  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  34.86 
 
 
971 aa  330  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  34.64 
 
 
1115 aa  320  9e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.89 
 
 
1000 aa  318  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  31.99 
 
 
1109 aa  317  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.11 
 
 
1099 aa  313  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  32.82 
 
 
1116 aa  312  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  32.39 
 
 
1045 aa  310  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  31.27 
 
 
1406 aa  299  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  31.95 
 
 
1109 aa  297  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  32.26 
 
 
994 aa  280  9e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  31.7 
 
 
1099 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 
1293 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.91 
 
 
1474 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  29.28 
 
 
1258 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  28.3 
 
 
1287 aa  261  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  29.12 
 
 
1300 aa  258  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.08 
 
 
1199 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  33.1 
 
 
1639 aa  257  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  29.35 
 
 
1265 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.79 
 
 
1638 aa  254  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  28.74 
 
 
1300 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.77 
 
 
1659 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 
1638 aa  250  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.77 
 
 
1649 aa  241  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  28.37 
 
 
1298 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  28 
 
 
1298 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  32.01 
 
 
1321 aa  238  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.08 
 
 
1649 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  27.9 
 
 
1298 aa  234  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  27.82 
 
 
1298 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  30.35 
 
 
1638 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.52 
 
 
1312 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.41 
 
 
1645 aa  227  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  31.04 
 
 
1725 aa  225  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  30 
 
 
1634 aa  224  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  32.44 
 
 
1739 aa  222  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.54 
 
 
1648 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  32.04 
 
 
1407 aa  212  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.01 
 
 
1648 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.01 
 
 
1648 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  32.04 
 
 
1407 aa  212  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 
1283 aa  211  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  32.03 
 
 
1407 aa  209  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  31.74 
 
 
1406 aa  205  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 
1399 aa  205  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.72 
 
 
1286 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  28.85 
 
 
1705 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  28.85 
 
 
1705 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 
1706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.08 
 
 
1669 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 
1292 aa  197  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 
1705 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.87 
 
 
728 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.79 
 
 
1160 aa  182  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  29.73 
 
 
1683 aa  178  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.39 
 
 
1323 aa  162  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  34.29 
 
 
962 aa  157  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
1212 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.29 
 
 
1215 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  31.1 
 
 
1035 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  29.91 
 
 
1618 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.79 
 
 
891 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  26.38 
 
 
1220 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.02 
 
 
1776 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.64 
 
 
860 aa  139  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.51 
 
 
915 aa  138  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  26.42 
 
 
917 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  26.86 
 
 
917 aa  138  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  26.86 
 
 
917 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.82 
 
 
917 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  26.64 
 
 
917 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.36 
 
 
1212 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  26.59 
 
 
917 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  26.59 
 
 
917 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  26.52 
 
 
917 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.12 
 
 
1212 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.12 
 
 
1212 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
860 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  26.94 
 
 
917 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 
1124 aa  130  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  28.57 
 
 
1809 aa  130  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  26.29 
 
 
1570 aa  125  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  26.15 
 
 
1570 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  27.26 
 
 
1570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  27.27 
 
 
2042 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.42 
 
 
1565 aa  116  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.79 
 
 
660 aa  112  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.11 
 
 
1383 aa  110  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  27.85 
 
 
1962 aa  110  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.6 
 
 
883 aa  109  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.79 
 
 
1234 aa  97.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  27.23 
 
 
1233 aa  97.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  26.38 
 
 
1221 aa  94.7  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.06 
 
 
1075 aa  85.1  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.78 
 
 
1092 aa  83.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  34.58 
 
 
1239 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>