More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3819 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 165 aa  163  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  40.41 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 203 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 180 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 179 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.34 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 181 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  30.52 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.26 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  26.17 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  29.25 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  29.93 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  29.93 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  27.59 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  35.78 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.67 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  26.9 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  26.9 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  26.9 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  26.9 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  26.9 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.37 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  27.78 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>