259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3738 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  79.52 
 
 
493 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  953    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  45.98 
 
 
486 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  34.89 
 
 
469 aa  257  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  32.89 
 
 
472 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  30.79 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.62 
 
 
469 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.27 
 
 
472 aa  142  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.93 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  27.09 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0685  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  24.03 
 
 
455 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2680  major facilitator transporter  23.87 
 
 
475 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.33 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.33 
 
 
460 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.17 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.61 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.58 
 
 
463 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  25.56 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  24.15 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  26.62 
 
 
467 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  27.39 
 
 
453 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.45 
 
 
464 aa  106  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  24.77 
 
 
439 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  24.1 
 
 
443 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  26.2 
 
 
480 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  25.12 
 
 
448 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  25.43 
 
 
461 aa  99.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.29 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  25.27 
 
 
468 aa  97.8  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  24.16 
 
 
524 aa  97.8  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  24.89 
 
 
506 aa  97.8  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.35 
 
 
445 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.45 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  22.95 
 
 
482 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3256  oligogalacturonide transporter  25.74 
 
 
508 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.69 
 
 
475 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.65 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  26.84 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2756  putative transport protein  24.03 
 
 
508 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000301777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.04 
 
 
476 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2835  putative transport protein  24.03 
 
 
508 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  24.44 
 
 
443 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.18 
 
 
497 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1449  putative transport protein  23.81 
 
 
508 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118167  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  24.1 
 
 
503 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  23.85 
 
 
625 aa  89.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.05 
 
 
442 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.63 
 
 
527 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  23.2 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  23.2 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  23.2 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  24.51 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  24.21 
 
 
462 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.26 
 
 
472 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.83 
 
 
436 aa  86.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  22.97 
 
 
457 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  22.97 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  22.97 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  39.82 
 
 
552 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  39.82 
 
 
552 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.83 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.87 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.27 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.14 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 
523 aa  84  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.08 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  22.43 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.62 
 
 
454 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.67 
 
 
441 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.37 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  32.75 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.61 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.39 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  39.82 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.15 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.15 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.15 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.1 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.49 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.21 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  22.96 
 
 
454 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  25.89 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.39 
 
 
441 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  23.54 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  23.21 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  23.54 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  24.04 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  23.54 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.28 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  23.54 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0971  oligogalacturonide transporter  24.63 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  23.54 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.27 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  23.54 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.54 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.6 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.54 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.46 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.738547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>