261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3732 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  70.09 
 
 
442 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  100 
 
 
443 aa  897    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  71 
 
 
443 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  69.23 
 
 
442 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  69.77 
 
 
441 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  68.55 
 
 
442 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  69.39 
 
 
441 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  68.78 
 
 
442 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  68.25 
 
 
441 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  67.87 
 
 
442 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  63.35 
 
 
444 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  47.75 
 
 
466 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  46.05 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  46.05 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  45.82 
 
 
468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  46.05 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  45.6 
 
 
468 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  45.15 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  42.86 
 
 
478 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  42.67 
 
 
478 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  42.57 
 
 
460 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.58 
 
 
477 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  42.57 
 
 
460 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  42.57 
 
 
479 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  42.57 
 
 
460 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  42.57 
 
 
479 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  42.34 
 
 
460 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  42.34 
 
 
479 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  42.79 
 
 
460 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  42.34 
 
 
460 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  42.57 
 
 
460 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  42.79 
 
 
460 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  42.79 
 
 
460 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  42.79 
 
 
460 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  42.34 
 
 
464 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  43.22 
 
 
442 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.63 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.63 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.4 
 
 
444 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.18 
 
 
444 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.79 
 
 
476 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.18 
 
 
444 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  42.4 
 
 
467 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  40.41 
 
 
459 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  40.61 
 
 
463 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  41.44 
 
 
448 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.41 
 
 
460 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  38.11 
 
 
461 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.96 
 
 
475 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.24 
 
 
465 aa  316  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.84 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.24 
 
 
471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.7 
 
 
481 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.78 
 
 
471 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.47 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  38.46 
 
 
447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.72 
 
 
465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3869  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.7 
 
 
486 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.17 
 
 
477 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.63 
 
 
497 aa  289  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03868  transport protein  35.55 
 
 
514 aa  286  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.02 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.1 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  39.41 
 
 
466 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.28 
 
 
472 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  39.41 
 
 
466 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  39.41 
 
 
466 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  39.19 
 
 
466 aa  276  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  36.53 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  42.17 
 
 
538 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  34.6 
 
 
511 aa  250  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  34.69 
 
 
465 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.85 
 
 
457 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.12 
 
 
468 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  32.89 
 
 
467 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.07 
 
 
467 aa  223  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  32.89 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  31.85 
 
 
467 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  31.75 
 
 
454 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  31.52 
 
 
454 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  32.67 
 
 
467 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  32.67 
 
 
467 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  30.65 
 
 
522 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.07 
 
 
513 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  32.08 
 
 
461 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.08 
 
 
461 aa  209  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  30.79 
 
 
457 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  31.86 
 
 
461 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  31.86 
 
 
468 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  29.91 
 
 
457 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  31.86 
 
 
468 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  31.86 
 
 
468 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  30.71 
 
 
457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  31.31 
 
 
457 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  30.71 
 
 
457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  30.71 
 
 
471 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  30.71 
 
 
471 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  31.31 
 
 
457 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  31.31 
 
 
457 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  31.31 
 
 
457 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>