More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3711 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3601  response regulator receiver domain-containing protein  28.28 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00274  transcriptional regulator, AraC family protein  29.9 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.96 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4046  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.11 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0023  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03507  hypothetical protein  25.11 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.702446  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5113  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4189  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.86 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  23.53 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 519 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  31.17 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  22.99 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  29.36 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  28.39 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  25.85 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  36.96 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.29 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  35.29 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8442  transcriptional regulator, AraC family  25.36 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  36.47 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  26.47 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  31.3 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2988  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>