238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3707 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  100 
 
 
511 aa  1016    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  71.26 
 
 
513 aa  750    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  59.54 
 
 
522 aa  598  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.57 
 
 
475 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.59 
 
 
463 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.1 
 
 
497 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.31 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3869  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.14 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.79 
 
 
472 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  33.73 
 
 
461 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.64 
 
 
465 aa  263  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.76 
 
 
477 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  34.6 
 
 
443 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  35.59 
 
 
462 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03868  transport protein  36.24 
 
 
514 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  50.43 
 
 
467 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.74 
 
 
441 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.54 
 
 
442 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.74 
 
 
441 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.5 
 
 
478 aa  224  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.13 
 
 
441 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.1 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.21 
 
 
471 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  46.55 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  46.98 
 
 
538 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  45.49 
 
 
442 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  46.35 
 
 
442 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  30.22 
 
 
459 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  42.29 
 
 
442 aa  206  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  28.91 
 
 
468 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  28.91 
 
 
468 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  28.91 
 
 
468 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  28.91 
 
 
468 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  29.11 
 
 
468 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  40.96 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  30.21 
 
 
460 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  30.56 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  30.21 
 
 
460 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  30.21 
 
 
460 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  30.21 
 
 
460 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.56 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  30.36 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  30.56 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  30.56 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  30.56 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  30.56 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  46.26 
 
 
443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.56 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  44.83 
 
 
465 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  30.36 
 
 
460 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  30.36 
 
 
460 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  44.87 
 
 
466 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  31.4 
 
 
464 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  42.62 
 
 
465 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.07 
 
 
477 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  43.46 
 
 
444 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  28.6 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  44.55 
 
 
460 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  29.82 
 
 
447 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  42.79 
 
 
442 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.76 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.76 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.76 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.76 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.76 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  38.75 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  38.75 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  38.75 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  38.75 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  40.87 
 
 
471 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  26.76 
 
 
467 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  27.59 
 
 
471 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  27.59 
 
 
471 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  27.59 
 
 
457 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  27.59 
 
 
457 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  34.87 
 
 
465 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  36.78 
 
 
437 aa  156  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  39.57 
 
 
481 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  39.57 
 
 
481 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  39.57 
 
 
481 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.26 
 
 
471 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  39.02 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  25.29 
 
 
457 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  26.13 
 
 
457 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  26.13 
 
 
457 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  25.49 
 
 
457 aa  146  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.12 
 
 
468 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  25.93 
 
 
457 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  25.29 
 
 
457 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.21 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.74 
 
 
457 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  34.93 
 
 
457 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.1 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  26.06 
 
 
461 aa  128  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  26.06 
 
 
461 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  26.06 
 
 
468 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.49 
 
 
461 aa  127  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.82 
 
 
474 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.82 
 
 
474 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.96 
 
 
475 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>