83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3555 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3555  putative outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  29.56 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  30 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3461  outer membrane lipoprotein LolB  26.77 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0667609  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  28.08 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  26.4 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  29.9 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2409  outer membrane lipoprotein LolB  29.9 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  28.35 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  25.6 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  25.12 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  25.74 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2116  outer membrane lipoprotein LolB  29.7 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  22.39 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0694  outer membrane lipoprotein LolB  26.29 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3739  outer membrane lipoprotein LolB  26.29 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.137488  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  24.62 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  24.5 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  24.5 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  24.5 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  24.5 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3616  outer membrane lipoprotein LolB  26.29 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  24.39 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  24.47 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  24.39 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3548  outer membrane lipoprotein LolB  26.29 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434882  hitchhiker  0.0000361379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  26.7 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  22.39 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  24.39 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  26.27 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  26.27 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  24.35 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  23.9 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004205  outer membrane lipoprotein LolB precursor  26.29 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000360033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3687  outer membrane lipoprotein LolB  27.5 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0163127  normal  0.471305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  23.62 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  23.62 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  25.3 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  15.27 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0721  outer membrane lipoprotein LolB  29.7 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0885014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  24.35 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  24.62 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  21.72 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  27.5 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3835  outer membrane lipoprotein LolB  25.77 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  21.72 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  22.93 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  27 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  22.5 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0767  outer membrane lipoprotein LolB  27.64 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000782252  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3171  outer membrane lipoprotein LolB  27.64 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00520564  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  27 
 
 
207 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  19.35 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0799  outer membrane lipoprotein LolB  25.74 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000308164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0795  outer membrane lipoprotein LolB  27.14 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000501463  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  23.64 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000324286  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  23.5 
 
 
200 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  19.81 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0291  outer membrane lipoprotein LolB  24.17 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2070  outer membrane lipoprotein LolB  23 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00533994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  17.42 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  19.62 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0998  outer membrane lipoprotein LolB  22.07 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  20 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  20 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  20.62 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  21.84 
 
 
190 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  17.81 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  20.1 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0724  outer membrane lipoprotein LolB  20.12 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.639372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  28.67 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>