More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3452 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  74.14 
 
 		 644 aa  984    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.14 
 
 		 647 aa  983    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  63.05 
 
 		 641 aa  785    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  50.59 
 
 		 764 aa  686    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  59.02 
 
 		 614 aa  722    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.95 
 
 		 637 aa  859    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.72 
 
 		 651 aa  843    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  67.4 
 
 		 638 aa  894    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.75 
 
 		 652 aa  700    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  58.69 
 
 		 628 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.43 
 
 		 617 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 660 aa  1355    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  57.29 
 
 		 644 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  73.39 
 
 		 649 aa  967    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  69.09 
 
 		 634 aa  852    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  74.88 
 
 		 644 aa  975    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.93 
 
 		 657 aa  961    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.19 
 
 		 627 aa  652    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  58.98 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  65.26 
 
 		 639 aa  850    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  65.26 
 
 		 639 aa  850    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  69.09 
 
 		 634 aa  852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.65 
 
 		 628 aa  658    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  63.93 
 
 		 626 aa  787    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  62.44 
 
 		 639 aa  776    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  67.77 
 
 		 642 aa  845    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.23 
 
 		 642 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  60.16 
 
 		 627 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  52.27 
 
 		 611 aa  653    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  65.04 
 
 		 630 aa  778    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  56.81 
 
 		 640 aa  680    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  58.98 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  58.98 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  71.19 
 
 		 641 aa  889    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  69.74 
 
 		 635 aa  860    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.82 
 
 		 645 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  58.18 
 
 		 616 aa  709    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.74 
 
 		 655 aa  768    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  59.17 
 
 		 632 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.56 
 
 		 641 aa  701    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 		 656 aa  715    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.98 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.16 
 
 		 663 aa  896    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.69 
 
 		 608 aa  722    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.64 
 
 		 647 aa  841    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  59.14 
 
 		 665 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.57 
 
 		 651 aa  817    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  68.37 
 
 		 640 aa  859    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.12 
 
 		 659 aa  835    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.98 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.74 
 
 		 631 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.93 
 
 		 640 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  58.98 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  59.14 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  53.16 
 
 		 635 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.77 
 
 		 638 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.98 
 
 		 644 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 		 636 aa  669    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.44 
 
 		 610 aa  644    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  57.46 
 
 		 649 aa  678    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.38 
 
 		 639 aa  777    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2720  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.85 
 
 		 641 aa  754    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.26 
 
 		 638 aa  685    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.84 
 
 		 631 aa  783    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.56 
 
 		 640 aa  775    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  58.58 
 
 		 629 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.76 
 
 		 656 aa  982    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.6 
 
 		 638 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.97 
 
 		 655 aa  795    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.43 
 
 		 638 aa  688    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.81 
 
 		 628 aa  663    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.36 
 
 		 649 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.32 
 
 		 627 aa  936    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  54.4 
 
 		 637 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  75.46 
 
 		 651 aa  994    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 		 647 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.33 
 
 		 627 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.06 
 
 		 657 aa  960    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.06 
 
 		 657 aa  960    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.95 
 
 		 656 aa  996    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.72 
 
 		 645 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.95 
 
 		 634 aa  860    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.45 
 
 		 655 aa  977    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  70.61 
 
 		 612 aa  912    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.24 
 
 		 640 aa  798    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  72.8 
 
 		 657 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  72.62 
 
 		 657 aa  965    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  66.56 
 
 		 639 aa  862    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.47 
 
 		 657 aa  974    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.73 
 
 		 621 aa  706    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.17 
 
 		 631 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  67.77 
 
 		 639 aa  844    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.33 
 
 		 631 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.72 
 
 		 652 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.32 
 
 		 673 aa  743    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  72.95 
 
 		 657 aa  969    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  58.98 
 
 		 628 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.65 
 
 		 621 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  72.46 
 
 		 650 aa  969    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  57.6 
 
 		 638 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>