237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3394 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  63.31 
 
 
402 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  60.89 
 
 
257 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  60.89 
 
 
257 aa  284  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  55.78 
 
 
412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  55.24 
 
 
405 aa  273  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  57.26 
 
 
406 aa  271  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  57.74 
 
 
409 aa  271  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  53.81 
 
 
408 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  53.39 
 
 
423 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  51.24 
 
 
413 aa  251  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  55.93 
 
 
405 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  49.4 
 
 
415 aa  248  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  54.94 
 
 
409 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  55.06 
 
 
407 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  54.69 
 
 
406 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  55.06 
 
 
406 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  56.25 
 
 
406 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  49.21 
 
 
410 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  50.83 
 
 
397 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  52.54 
 
 
405 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  51.2 
 
 
410 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  50.8 
 
 
410 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  55.14 
 
 
407 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  43.32 
 
 
256 aa  215  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  45.2 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  46.43 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  43.08 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  52.3 
 
 
408 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  42.86 
 
 
258 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  47.74 
 
 
418 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  45.23 
 
 
255 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  51.88 
 
 
408 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  42.4 
 
 
250 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  43.61 
 
 
256 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  37.13 
 
 
259 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 
256 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  54.17 
 
 
145 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  39.37 
 
 
411 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.64 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.45 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  29.78 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  25.89 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.73 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.89 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  35.11 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  29.26 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.21 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  26.02 
 
 
324 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  26.18 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  27 
 
 
348 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  28.11 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  23.65 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.48 
 
 
364 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  22.82 
 
 
319 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.11 
 
 
296 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  25.53 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.2 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  30.06 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  22.41 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  18.28 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  24.11 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  22.82 
 
 
319 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  22.84 
 
 
305 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.46 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.99 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  24.51 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  27.27 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  29.1 
 
 
473 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.81 
 
 
645 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  26.95 
 
 
690 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.81 
 
 
645 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  23.43 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  25.68 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.38 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  30.3 
 
 
305 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.81 
 
 
645 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  25.24 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  31.25 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13191  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  25.31 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0797843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.36 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  33.86 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  25.52 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  24.32 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  24.19 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  21.91 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  24.42 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1349  hypothetical protein  24.51 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108709  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.2 
 
 
588 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.03 
 
 
644 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  24.89 
 
 
311 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  26.67 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  24.17 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>