More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3350 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 342 aa  700    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  36.28 
 
 		 323 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  36.97 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  29.37 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.43 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.58 
 
 		 438 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  28.44 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.55 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  29.27 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.68 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.23 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  25.3 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  27.8 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  23.95 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.16 
 
 		 335 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.16 
 
 		 335 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.56 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.61 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.51 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.96 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.55 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.04 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  26.97 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 264 aa  86.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.63 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.04 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  23.72 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.08 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.63 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  25.79 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  27.12 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.8 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  30 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  26.87 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.22 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>