253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3326 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  100 
 
 
335 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.81 
 
 
354 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  44.48 
 
 
325 aa  275  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  44.37 
 
 
332 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  41.12 
 
 
361 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.16 
 
 
325 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  44.05 
 
 
332 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  41.72 
 
 
344 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  39.34 
 
 
362 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  42.77 
 
 
358 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  43.61 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  41.47 
 
 
334 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  41.4 
 
 
328 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  41.08 
 
 
353 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  38.46 
 
 
344 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  40.65 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  40.76 
 
 
353 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  40.48 
 
 
330 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 
353 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  42.61 
 
 
324 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  41.22 
 
 
330 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 
351 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
352 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
353 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
353 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  39.92 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  40.91 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  39.18 
 
 
353 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  38.33 
 
 
337 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  36.94 
 
 
336 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  39.69 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  39.48 
 
 
329 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 
332 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  40.25 
 
 
335 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  39.77 
 
 
369 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  37.59 
 
 
362 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  38.19 
 
 
423 aa  195  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  39.12 
 
 
324 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  39.46 
 
 
324 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  39.12 
 
 
324 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  39.12 
 
 
324 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  39.12 
 
 
324 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  38.49 
 
 
356 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  42.13 
 
 
324 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  40.08 
 
 
324 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  38.36 
 
 
324 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  38.01 
 
 
324 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  43.03 
 
 
324 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.39 
 
 
335 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.29 
 
 
376 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.68 
 
 
362 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  32.59 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  31.39 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  35.31 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  35.31 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  35.31 
 
 
329 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.84 
 
 
364 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  40.39 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  40.4 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  34.67 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  35.97 
 
 
388 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  31.99 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37 
 
 
318 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  38.55 
 
 
362 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.96 
 
 
368 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  41.09 
 
 
361 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  34.06 
 
 
356 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  36.82 
 
 
357 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.89 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  37.45 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.89 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.06 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.06 
 
 
372 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  33.13 
 
 
380 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  33.96 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  39.38 
 
 
383 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  35.74 
 
 
366 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38 
 
 
364 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.35 
 
 
386 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  34.52 
 
 
372 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  34.52 
 
 
372 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  34.52 
 
 
372 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  39.13 
 
 
374 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  35.52 
 
 
367 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.57 
 
 
374 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  33.11 
 
 
363 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  34.38 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  34.39 
 
 
365 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  33.12 
 
 
374 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  39.13 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  39.13 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  31.69 
 
 
376 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.59 
 
 
385 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  32.82 
 
 
376 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  36.12 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  33.98 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 
372 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  33.99 
 
 
330 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  32.73 
 
 
414 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  38.14 
 
 
296 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>