More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3277 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  54.1 
 
 		 635 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 635 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  55.37 
 
 		 639 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  54.1 
 
 		 635 aa  673    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  100 
 
 		 645 aa  1309    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  50.92 
 
 		 640 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  54.19 
 
 		 637 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  51.55 
 
 		 641 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 		 646 aa  685    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  55.05 
 
 		 639 aa  691    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  54.17 
 
 		 635 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  54.1 
 
 		 635 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  53.72 
 
 		 635 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  54.17 
 
 		 635 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  54.11 
 
 		 636 aa  676    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 		 638 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  54.1 
 
 		 635 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  51.55 
 
 		 641 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  53.94 
 
 		 635 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  52.57 
 
 		 637 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  54.08 
 
 		 642 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  54.28 
 
 		 639 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  54.1 
 
 		 635 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  54.35 
 
 		 637 aa  717    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  54.17 
 
 		 635 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  54.1 
 
 		 635 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  51.55 
 
 		 641 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  54.25 
 
 		 635 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  54.17 
 
 		 635 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  55.83 
 
 		 636 aa  671    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  53.16 
 
 		 649 aa  679    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  52.8 
 
 		 647 aa  687    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  51.55 
 
 		 641 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  51.55 
 
 		 641 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  53.81 
 
 		 634 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  51.62 
 
 		 640 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  51.47 
 
 		 640 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  54.17 
 
 		 635 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  54.19 
 
 		 637 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  51.86 
 
 		 640 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  51.08 
 
 		 639 aa  634  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  50.85 
 
 		 638 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  51.46 
 
 		 640 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  50.77 
 
 		 645 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  51.39 
 
 		 638 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  50 
 
 		 638 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  49.07 
 
 		 631 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  50.77 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  47.69 
 
 		 650 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0797  ABC transporter ATPase component  51.7 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 633 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  47.15 
 
 		 642 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  45.51 
 
 		 632 aa  559  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  45.03 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  45.65 
 
 		 640 aa  561  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  46.12 
 
 		 643 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  45.36 
 
 		 653 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  46.43 
 
 		 642 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  45.03 
 
 		 636 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  46.58 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 632 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  46.43 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  45.51 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 		 615 aa  544  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  46.82 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  47.14 
 
 		 641 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  44.21 
 
 		 648 aa  542  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  46.13 
 
 		 623 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  46.76 
 
 		 640 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  43.26 
 
 		 640 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  43.75 
 
 		 648 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  43.5 
 
 		 642 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  46.83 
 
 		 639 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  42.7 
 
 		 645 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  44.62 
 
 		 645 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  43.55 
 
 		 637 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 637 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  43.55 
 
 		 641 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  42.5 
 
 		 641 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 636 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  42.35 
 
 		 626 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  41.76 
 
 		 648 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  43.79 
 
 		 641 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  44.48 
 
 		 639 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  43.17 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 		 629 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 648 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 660 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  43.34 
 
 		 617 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  41.67 
 
 		 649 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 1065 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 648 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  41.74 
 
 		 661 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 648 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  41.67 
 
 		 649 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 		 640 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  41.74 
 
 		 661 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  41.74 
 
 		 649 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>