More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3271 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3271  response regulator  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  70.56 
 
 		 214 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  70.09 
 
 		 214 aa  322  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  67.76 
 
 		 227 aa  313  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  65.42 
 
 		 218 aa  308  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  66.82 
 
 		 214 aa  305  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  64.02 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  64.02 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  64.02 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.58 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  65.58 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  65.58 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  65.58 
 
 		 218 aa  299  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  63.55 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  65.58 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  65.58 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  65.58 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  64.65 
 
 		 218 aa  297  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  64.65 
 
 		 218 aa  297  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  64.65 
 
 		 218 aa  297  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  64.65 
 
 		 218 aa  297  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  66.35 
 
 		 229 aa  297  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  63.55 
 
 		 218 aa  297  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  63.08 
 
 		 218 aa  296  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  65.12 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  62.5 
 
 		 220 aa  295  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  64.19 
 
 		 218 aa  294  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  66.99 
 
 		 214 aa  294  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  65.42 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  66.51 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  66.51 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  66.51 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  66.51 
 
 		 214 aa  292  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  66.51 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  66.51 
 
 		 214 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  65.42 
 
 		 214 aa  291  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  65.55 
 
 		 226 aa  291  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  66.03 
 
 		 214 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  65.28 
 
 		 216 aa  289  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  70.21 
 
 		 188 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  64.93 
 
 		 214 aa  284  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  63.98 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 214 aa  278  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  58.88 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01869  hypothetical protein  64.89 
 
 		 191 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000330184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  55.71 
 
 		 214 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  55.71 
 
 		 214 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  56.19 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  56.94 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  55.24 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3067  two component LuxR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 208 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  55.12 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  50 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  50 
 
 		 219 aa  234  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01879  response regulator  65.66 
 
 		 169 aa  231  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000614586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3672  two component LuxR family transcriptional regulator  55.49 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  hitchhiker  0.000000290511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  44.13 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  41.78 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  42.25 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  41.71 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3242  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000371761  hitchhiker  0.000468813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  39.52 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2054  response regulator receiver domain-containing protein  50.56 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595634 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 211 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.023063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  38.65 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  36.97 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>