More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3243 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
337 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  56.7 
 
 
341 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  50.93 
 
 
347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  48.34 
 
 
357 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  45.73 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  46.95 
 
 
351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  47.65 
 
 
344 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  44.34 
 
 
347 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
327 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
318 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
318 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
305 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
333 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
374 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
316 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
299 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 
324 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
380 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
398 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
357 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
300 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
386 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
1250 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
390 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
280 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
255 aa  122  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.62 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.74 
 
 
466 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
303 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
250 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
326 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
323 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
597 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  35.18 
 
 
345 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
333 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  35.78 
 
 
311 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 
320 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  29.12 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.19 
 
 
295 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  45.86 
 
 
326 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
321 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.58 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
363 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
334 aa  113  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
310 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.89 
 
 
326 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
663 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 
704 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
302 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.04 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 
672 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
337 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
244 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
1035 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
342 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
280 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
1156 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
358 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  30.36 
 
 
321 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.88 
 
 
312 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
544 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  33.77 
 
 
314 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
327 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  34.47 
 
 
318 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
230 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
317 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
344 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
337 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.32 
 
 
340 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 
573 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
322 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
289 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
301 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
233 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
777 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  40.5 
 
 
727 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.39 
 
 
253 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
306 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
235 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>