More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2986 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  47.19 
 
 
262 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  38.36 
 
 
279 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  43.72 
 
 
276 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.77 
 
 
475 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  38.01 
 
 
446 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  37.39 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  31.61 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 
922 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  33.61 
 
 
336 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  33.77 
 
 
611 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  35.22 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  32.59 
 
 
952 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  32.51 
 
 
925 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  28.61 
 
 
289 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.74 
 
 
820 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  30.42 
 
 
296 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  30.74 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  33.61 
 
 
929 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  33.61 
 
 
254 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  30.04 
 
 
276 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.33 
 
 
346 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  32.78 
 
 
287 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  29.06 
 
 
877 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  30.47 
 
 
802 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  29.75 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
617 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  33.04 
 
 
267 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  34.31 
 
 
657 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  32.33 
 
 
298 aa  112  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  36.42 
 
 
636 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  28.63 
 
 
664 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
625 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  31.28 
 
 
285 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  29.01 
 
 
538 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  33.47 
 
 
654 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  31.78 
 
 
267 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
623 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
620 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.81 
 
 
654 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 
618 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
715 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  30.58 
 
 
781 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  30.89 
 
 
329 aa  105  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.87 
 
 
892 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  29.25 
 
 
768 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  33.65 
 
 
637 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  28.28 
 
 
233 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.39 
 
 
416 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
621 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
882 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  31.25 
 
 
603 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  28.99 
 
 
351 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
593 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  31.95 
 
 
772 aa  102  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  31.56 
 
 
287 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 
555 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
616 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.91 
 
 
277 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 
453 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  28 
 
 
1196 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.34 
 
 
398 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  27.06 
 
 
230 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  31.38 
 
 
413 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.91 
 
 
1911 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  29.71 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  26.98 
 
 
223 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  32.63 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 
509 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  25.89 
 
 
224 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  28 
 
 
226 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 
637 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  31.35 
 
 
862 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  29.32 
 
 
740 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
554 aa  95.9  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  29.02 
 
 
488 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  30.73 
 
 
527 aa  95.5  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
323 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  25.7 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  27.71 
 
 
226 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  26.78 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 
489 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  29.41 
 
 
522 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
1104 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5411  protein of unknown function DUF323  29.08 
 
 
719 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  28.28 
 
 
225 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30.42 
 
 
616 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  27.76 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  28.69 
 
 
214 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  26.55 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
1043 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  27.53 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  25.52 
 
 
401 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>