More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2889 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2889  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  1.82855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2890  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  2.00194e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2891  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  1.94238e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2892  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  1.82855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  91.78 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  91.78 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  91.78 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  2.73116e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  91.78 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0079  tRNA-Asn  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  5.05976e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0077  tRNA-Asn  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  4.77509e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0078  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  6.16028e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  2.27587e-09  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.81489e-13  hitchhiker  6.92381e-07 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  8.64029e-13  hitchhiker  4.18087e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  88.89 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  88.89 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  88.89 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  88.89 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0076  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  5.96623e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0072  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.49142e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0071  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.29648e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0080  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  3.90034e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0069  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.02362e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  88.89 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0025  tRNA-Lys  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0132598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0415  tRNA-Lys  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0379576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0174  tRNA-Lys  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0072  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0416194  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0074  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.84221e-06  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.44921e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0075  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.59002e-06  normal  0.199391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0124  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.41621e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0068  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0474424  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.6805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0070  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042051  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0071  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0401239  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0120  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.02626e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0121  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.17493e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0122  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24513e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0123  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.14106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0074  tRNA-Asn  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0206519  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1828  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  4.01968e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0052  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  7.7031e-13  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0053  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.46858e-10  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0031  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  4.20525e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1827  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  3.83141e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  8.3016e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2876  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  6.08308e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2815  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  6.87096e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2778  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  1.36224e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2816  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  2.13443e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  3.48439e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  1.29233e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2504  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  2.20613e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0029  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0902412  normal  0.0228096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0032  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  3.99959e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2505  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.58439e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  2.19995e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0015  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  9.0416e-06  normal  0.096467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1695  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  3.9183e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1694  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  6.55651e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0034  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.25096e-09  normal  0.395781 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2777  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  1.32175e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2934  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.07091e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.03893e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  6.83779e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  7.33307e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  2.34259e-08  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0030  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0012  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00139972  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0033  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.24831e-08  normal  0.39291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0018  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  3.18687e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0017  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.97879e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0033  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.61489e-08  normal  0.861574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  7.66368e-14  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0039  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0034  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  9.27259e-12  normal  0.865314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0034  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  8.16877e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0033  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.06516e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1934  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.810073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.1783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  4.69656e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0036  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0044  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.975167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0058  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0204591  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.68933e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  6.72543e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.81863e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  6.13104e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  87.69 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.54506e-13  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>