More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2888 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  920    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  56.16 
 
 		 460 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  55.66 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  43.85 
 
 		 456 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  43.15 
 
 		 452 aa  352  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  42.98 
 
 		 454 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  43.46 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  42.01 
 
 		 455 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  42.69 
 
 		 451 aa  339  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  42.01 
 
 		 455 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  42.01 
 
 		 455 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  42.01 
 
 		 455 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  43.65 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  42.92 
 
 		 455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  42.69 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  42.92 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  43.61 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  42.47 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  42.01 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  43.02 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  40.41 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  38.89 
 
 		 451 aa  317  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  38.38 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  37.59 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  36.79 
 
 		 444 aa  249  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  35.76 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 442 aa  247  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  36.32 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  35.76 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  36.63 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  34.86 
 
 		 454 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 498 aa  206  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.2 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  31.97 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  30.34 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 515 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 515 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 515 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 515 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 518 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  31.97 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  30.48 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  31.13 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  33.09 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 495 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 521 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  29.9 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 525 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  32.09 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 477 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 500 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 500 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  30.14 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 538 aa  143  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>