297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2883 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  464  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  68.18 
 
 		 226 aa  335  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  58.11 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  58.56 
 
 		 222 aa  284  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  57.66 
 
 		 222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  56.76 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  57.66 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  60.27 
 
 		 224 aa  281  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  57.21 
 
 		 222 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  57.21 
 
 		 222 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  56.76 
 
 		 222 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  56.76 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  57.85 
 
 		 248 aa  279  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  56.31 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  56.76 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  56.76 
 
 		 222 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  56.76 
 
 		 222 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  59.09 
 
 		 245 aa  277  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  57.21 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  58.11 
 
 		 223 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  58.11 
 
 		 223 aa  274  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  58.11 
 
 		 223 aa  274  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  58.11 
 
 		 223 aa  274  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  58.11 
 
 		 223 aa  274  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  57.73 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  57.85 
 
 		 223 aa  271  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  59.55 
 
 		 226 aa  271  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  58.3 
 
 		 223 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  57.85 
 
 		 223 aa  270  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  58.11 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  54.95 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  57.21 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  57.92 
 
 		 224 aa  267  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  53.6 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  54.05 
 
 		 222 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  56.36 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  57.67 
 
 		 216 aa  257  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  54.05 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  54.05 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  54.05 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  51.8 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  54.71 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  44.54 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  42.15 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  36.87 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  34.07 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  28.63 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.16 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  34.98 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  31.72 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  32.88 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  31.51 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.42 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  33.03 
 
 		 193 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.51 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  31.7 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  33.33 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  31.9 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  31.7 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  31.88 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  31.47 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  31.88 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  31.85 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  30.25 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  30.8 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  31.8 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  30.67 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  30.8 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  31.4 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  29.41 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  32.23 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  31.8 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  28.98 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  28.15 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>