259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2854 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  49.1 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  49.12 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  44.84 
 
 
236 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  48.25 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  48.25 
 
 
285 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  48.25 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  48.25 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  46.3 
 
 
247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  46.32 
 
 
255 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  46.32 
 
 
255 aa  194  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  47 
 
 
238 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  45.78 
 
 
245 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  49.52 
 
 
231 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  43.36 
 
 
239 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  48.61 
 
 
230 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  46.46 
 
 
286 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  41.67 
 
 
252 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  41.94 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  41.31 
 
 
230 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  40.43 
 
 
233 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  40.85 
 
 
230 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  40.85 
 
 
230 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  41.94 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  39.21 
 
 
244 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  39.65 
 
 
244 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  34.38 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  33.61 
 
 
258 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  36.61 
 
 
244 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  38.83 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  33.63 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  34.27 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.31 
 
 
253 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  33.04 
 
 
255 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  38.6 
 
 
249 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.65 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  35.21 
 
 
255 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  38.6 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  29.86 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  37.57 
 
 
257 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  37.57 
 
 
257 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  38.15 
 
 
280 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  38.15 
 
 
255 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  36.47 
 
 
250 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  36.9 
 
 
233 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.64 
 
 
228 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  34.04 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.25 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  27.95 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.41 
 
 
228 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  31.77 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  26.13 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.5 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  28 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  29.41 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  31.82 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  33.7 
 
 
307 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.76 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  29.07 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.58 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  32.63 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  30.32 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  29.79 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  29.39 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  28.26 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  29.79 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.81 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.41 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  29.79 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  29.17 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  30.06 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  28.19 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  33.53 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  28.7 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  29.67 
 
 
241 aa  82  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.93 
 
 
241 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.38 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.38 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  28.38 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.38 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.38 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.75 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  28.38 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  29.77 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.38 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  27.78 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  31.35 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.93 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.93 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  33.14 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  29.69 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  31.22 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  26.69 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  29.67 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  30.13 
 
 
256 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.51 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  25.45 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  26.69 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  25.35 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  29.26 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>