More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2818 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 853 aa  1715    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  57.96 
 
 		 870 aa  952    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  77 
 
 		 948 aa  1345    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  38.69 
 
 		 797 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 		 817 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 797 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 797 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 803 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 797 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 812 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 812 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 812 aa  525  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 843 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  37.84 
 
 		 797 aa  505  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 853 aa  497  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 817 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 847 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  36.69 
 
 		 795 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 933 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  35.09 
 
 		 788 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  37.31 
 
 		 848 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 918 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 788 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  34.32 
 
 		 784 aa  435  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 887 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 795 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 874 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 803 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 793 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.81 
 
 		 800 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  32.67 
 
 		 793 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 924 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.07 
 
 		 856 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 800 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.88 
 
 		 840 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 924 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  32.93 
 
 		 864 aa  389  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 795 aa  386  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 811 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.23 
 
 		 811 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.64 
 
 		 867 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 868 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 857 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 947 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 851 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.12 
 
 		 1015 aa  365  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.47 
 
 		 799 aa  362  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 871 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 877 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 961 aa  357  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 867 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 858 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 867 aa  350  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 861 aa  350  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 815 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 870 aa  337  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 869 aa  337  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 850 aa  334  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.22 
 
 		 821 aa  333  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  30.37 
 
 		 884 aa  333  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.25 
 
 		 832 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 883 aa  330  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 815 aa  326  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 835 aa  322  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 804 aa  319  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 872 aa  316  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 811 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.43 
 
 		 823 aa  312  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 833 aa  306  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 800 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 849 aa  303  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 842 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 987 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 847 aa  295  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.54 
 
 		 818 aa  295  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 816 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 842 aa  246  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 885 aa  244  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 858 aa  231  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  31.32 
 
 		 948 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 813 aa  226  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 852 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 873 aa  191  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.38 
 
 		 839 aa  177  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 841 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 838 aa  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 853 aa  160  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.27 
 
 		 853 aa  160  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 843 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 904 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  25.03 
 
 		 899 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 904 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 904 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 879 aa  140  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 904 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 867 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 867 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 895 aa  131  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 867 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 		 907 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>