More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2778 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  722    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  54.1 
 
 
303 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  53.19 
 
 
303 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  56.19 
 
 
315 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  55.66 
 
 
303 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  52.58 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  54.46 
 
 
305 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  52.58 
 
 
303 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  53.37 
 
 
303 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  51.98 
 
 
303 aa  331  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  55.45 
 
 
303 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  55.45 
 
 
313 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  55.13 
 
 
303 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  55.13 
 
 
303 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  51.96 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  55.97 
 
 
305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  52.81 
 
 
303 aa  325  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  50.45 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.35 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  53.35 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  53.35 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  53.7 
 
 
308 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  50.62 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  52.49 
 
 
306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.64 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  56.36 
 
 
321 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  49.17 
 
 
308 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.67 
 
 
323 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.67 
 
 
323 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.48 
 
 
317 aa  298  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.33 
 
 
300 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  47.71 
 
 
317 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  54.18 
 
 
312 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  48.33 
 
 
302 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  50 
 
 
306 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.4 
 
 
317 aa  295  8e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  52.19 
 
 
303 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  51.97 
 
 
305 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  52.37 
 
 
315 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  51.99 
 
 
349 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  51.68 
 
 
315 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  51.97 
 
 
305 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  52.65 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  47.02 
 
 
315 aa  288  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  50.66 
 
 
304 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  51.96 
 
 
306 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  50 
 
 
306 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  50.33 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.13 
 
 
329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  49.33 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  48.68 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  50.65 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.67 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  48.68 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  49.67 
 
 
306 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.16 
 
 
313 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  52.49 
 
 
305 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  52.16 
 
 
305 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 
306 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  50.33 
 
 
306 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  48.25 
 
 
335 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  45.66 
 
 
335 aa  275  8e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.65 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  43.75 
 
 
347 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  44 
 
 
320 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.83 
 
 
308 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  44 
 
 
320 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  44 
 
 
320 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.41 
 
 
305 aa  269  5e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  44.74 
 
 
310 aa  268  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  41.41 
 
 
308 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  42.99 
 
 
305 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.77 
 
 
325 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  46.82 
 
 
310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  43.3 
 
 
317 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.16 
 
 
305 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  48.29 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  43.38 
 
 
320 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.65 
 
 
305 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.48 
 
 
324 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  42.86 
 
 
323 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 
324 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  42.77 
 
 
320 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.82 
 
 
333 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.6 
 
 
327 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.47 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  48.68 
 
 
310 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  42.07 
 
 
305 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  46.82 
 
 
335 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.3 
 
 
327 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  42.35 
 
 
320 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.96 
 
 
324 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  42.35 
 
 
320 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.23 
 
 
341 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.89 
 
 
322 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.71 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  43.46 
 
 
314 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2037  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.04 
 
 
316 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.94 
 
 
327 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.9 
 
 
325 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>