More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2623 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 451 aa  931    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  47.12 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  45.41 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  46.55 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  45.78 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  48.01 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  47.79 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  46 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  46.44 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  45.92 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  46.58 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  47.48 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  45.27 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  45.7 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  45.58 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.81 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  45.35 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  46.59 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  47.47 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  46.59 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  43.58 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  45.25 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  45.68 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  43.56 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  42.48 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  44.37 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  43.93 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  46.62 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  42.48 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  42.26 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.91 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  43.75 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  43.58 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  43.81 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  43.58 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  43.79 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  44.05 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  43.58 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  43.58 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  43.36 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  43.36 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  43.36 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  44.34 
 
 		 461 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  44.93 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  44.93 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.15 
 
 		 541 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  41.24 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.01 
 
 		 460 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.63 
 
 		 536 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.95 
 
 		 525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  39.74 
 
 		 469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.14 
 
 		 543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 524 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  37.53 
 
 		 467 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.4 
 
 		 525 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 463 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.36 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.58 
 
 		 540 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 465 aa  305  8.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  38.15 
 
 		 470 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 		 468 aa  302  8.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 		 468 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 		 535 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  37.07 
 
 		 469 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 466 aa  299  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 		 544 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 		 464 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.59 
 
 		 530 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.07 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  35.47 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  38.68 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  36.17 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  39.43 
 
 		 540 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  36.83 
 
 		 570 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 		 465 aa  289  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  39.37 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 536 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.72 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  39.73 
 
 		 542 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  35.11 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.54 
 
 		 466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.55 
 
 		 474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.86 
 
 		 455 aa  282  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.13 
 
 		 532 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  39.59 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 		 547 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.27 
 
 		 468 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>