60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2610 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1186    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  26.21 
 
 		 582 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  28.66 
 
 		 604 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  26.21 
 
 		 598 aa  180  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  26.21 
 
 		 598 aa  180  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  26.21 
 
 		 598 aa  180  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  26.52 
 
 		 602 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  25.6 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  27.27 
 
 		 596 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.27 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  26.63 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  25.65 
 
 		 595 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  25.61 
 
 		 582 aa  177  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  27.11 
 
 		 596 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  27.23 
 
 		 596 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  26.95 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  25.45 
 
 		 594 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  26.43 
 
 		 595 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  25 
 
 		 602 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  26.95 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  26.67 
 
 		 595 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  26.62 
 
 		 595 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  30.03 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  30.89 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  30.89 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  30.89 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  30.89 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  30.89 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  25.81 
 
 		 594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  26.56 
 
 		 601 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  25 
 
 		 590 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  24.8 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  36.44 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  26.09 
 
 		 596 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  28.46 
 
 		 580 aa  151  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  26.94 
 
 		 508 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  30.03 
 
 		 593 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  34.07 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  25.29 
 
 		 594 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  24.16 
 
 		 595 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  25.78 
 
 		 609 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  22.11 
 
 		 617 aa  73.9  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  22.11 
 
 		 617 aa  73.9  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  23.85 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  24.66 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  26.1 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  24.41 
 
 		 607 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  24.76 
 
 		 637 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  24.28 
 
 		 625 aa  51.2  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  24.36 
 
 		 637 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  22.51 
 
 		 615 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  20.07 
 
 		 600 aa  43.9  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>