152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2583 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2583  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000106409  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000310514  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138663  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000703577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000226469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  54.02 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000014177  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  51.14 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000660845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000555789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181978  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2373  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2446  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000625931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  48.89 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1955  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00065968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1501  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00311098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1317  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000676449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2015  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00111528  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1958  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000738777  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01149  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1659  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1327  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000455386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01159  hypothetical protein  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000236867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1318  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000349629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2451  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1975  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  52.87 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  52.87 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  48.31 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000024687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1065  cell division topological specificity factor MinE  53.41 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00330436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1995  cell division topological specificity factor MinE  51.61 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0206269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1938  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  50.56 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  49.44 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000201972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  51.72 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  47.19 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000749363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01606  cell division topological specificity factor MinE  48.89 
 
 		 86 aa  83.6  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.38855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  51.72 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  51.72 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  50.57 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004088  cell division topological specificity factor MinE  47.19 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  51.72 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  47.83 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  47.83 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  50.57 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  50.57 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  46.67 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  49.41 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  49.43 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  47.13 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01383  cell division topological specificity factor MinE  46.07 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  48.91 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  48.91 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2758  cell division topological specificity factor MinE  48.31 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000733452  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  48.86 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  48.28 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2012  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2401  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000142715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2123  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  45.98 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  49.43 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  46.67 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  47.13 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  44.71 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  45.16 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  47.73 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  43.68 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2337  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  44 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  42.7 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  45.98 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  42.7 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2352  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0614704  normal  0.0900841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>