26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2561 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  100 
 
 		 237 aa  490  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  26.55 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  24.35 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  24.77 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  24.78 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  24.49 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  21.68 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  21.43 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  23.32 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  26.95 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  23.28 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  20 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  25.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  25.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  25.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 226 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  23.78 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>