More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2413 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 319 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  29.91 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 922 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 897 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 858 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  84 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 881 aa  56.2  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 932 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 932 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 932 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 932 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 848 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 896 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 930 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  76.92 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 864 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 932 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  82.61 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 921 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 837 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 834 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 910 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 836 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 958 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 921 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  54.17 
 
 		 918 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  74.07 
 
 		 923 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 1031 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 838 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 844 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 888 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  55 
 
 		 162 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 872 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 910 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  48.94 
 
 		 593 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 845 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 909 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 957 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 921 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  48.08 
 
 		 170 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 915 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  52.27 
 
 		 921 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 944 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  90.48 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 866 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  94.74 
 
 		 731 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  94.74 
 
 		 731 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  80.77 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  60 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  60 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  38.36 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  54.29 
 
 		 939 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 904 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  45.65 
 
 		 1102 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  60 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 1118 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  46.67 
 
 		 921 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  60 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  95 
 
 		 535 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  71.43 
 
 		 830 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  60 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 104 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 894 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 936 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  60 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 934 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  53.66 
 
 		 899 aa  51.2  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 934 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  70.37 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  69.23 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 934 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 936 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  60 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  59.38 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 936 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 912 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>