More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2411 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  49.76 
 
 		 831 aa  214  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  52.85 
 
 		 684 aa  212  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  53.61 
 
 		 789 aa  206  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  53.06 
 
 		 1402 aa  205  6e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.54 
 
 		 318 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  51.01 
 
 		 961 aa  199  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  48.94 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  46.15 
 
 		 489 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  52.04 
 
 		 1493 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  45.89 
 
 		 557 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  52.33 
 
 		 448 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  54.64 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  46.72 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  50.78 
 
 		 393 aa  188  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  50.51 
 
 		 425 aa  188  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  50.72 
 
 		 2413 aa  186  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  48.98 
 
 		 838 aa  184  8e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.27 
 
 		 341 aa  180  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  47.85 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  46.34 
 
 		 305 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  48.94 
 
 		 416 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.76 
 
 		 343 aa  179  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.06 
 
 		 528 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  46.73 
 
 		 1037 aa  176  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  47.96 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  48.69 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  47.47 
 
 		 490 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  43.5 
 
 		 376 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  43.04 
 
 		 376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  46.97 
 
 		 685 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  47.45 
 
 		 490 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  41.38 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  45.55 
 
 		 1002 aa  169  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  47.03 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.41 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  45.41 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.49 
 
 		 346 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  43.75 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  48.26 
 
 		 1877 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  47.98 
 
 		 464 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  44.9 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  43 
 
 		 327 aa  161  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.72 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  49.38 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.5 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  38.78 
 
 		 373 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.73 
 
 		 392 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  46.5 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  43.48 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  48.54 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  41.05 
 
 		 731 aa  157  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  38.02 
 
 		 373 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.1 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  43.07 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  42.33 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  40.87 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.5 
 
 		 278 aa  152  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.56 
 
 		 359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  41.33 
 
 		 331 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  41.33 
 
 		 331 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  41.33 
 
 		 331 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 		 1032 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  41.55 
 
 		 329 aa  149  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  39.8 
 
 		 331 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.63 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  38.14 
 
 		 509 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  38.14 
 
 		 509 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  38.36 
 
 		 509 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  38.36 
 
 		 509 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  41.05 
 
 		 763 aa  145  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  40.61 
 
 		 380 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.84 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  41.97 
 
 		 976 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  44.15 
 
 		 380 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  37.5 
 
 		 850 aa  141  8e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  45.4 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  39.9 
 
 		 482 aa  139  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.75 
 
 		 523 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  41.05 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  38.12 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  41.26 
 
 		 552 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.27 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.7 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  36.7 
 
 		 365 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.95 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 		 1430 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.13 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.73 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  40.22 
 
 		 839 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.69 
 
 		 865 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  40.43 
 
 		 358 aa  128  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  36.23 
 
 		 765 aa  126  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  37.63 
 
 		 505 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 415 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  43.23 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  41.82 
 
 		 172 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  39.2 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.77 
 
 		 348 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>