30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2383 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  100 
 
 
929 aa  1833  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.96 
 
 
503 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  30.2 
 
 
891 aa  111  7e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  4.42231e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  28.46 
 
 
890 aa  104  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  30.24 
 
 
886 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  30.89 
 
 
887 aa  102  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  29.48 
 
 
893 aa  101  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  1.52737e-07 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  31.08 
 
 
884 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1855e-15 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  27.56 
 
 
891 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.36329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  30.28 
 
 
530 aa  96.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 
727 aa  93.2  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  39.18 
 
 
729 aa  89.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  39.18 
 
 
729 aa  89.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  42.94 
 
 
967 aa  81.6  5e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  4.79173e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  35.62 
 
 
699 aa  80.5  1e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  38.89 
 
 
565 aa  77  2e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  30.81 
 
 
2588 aa  68.6  6e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  44.87 
 
 
795 aa  66.2  3e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  28.21 
 
 
1634 aa  64.3  1e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  39.53 
 
 
576 aa  55.5  5e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.46 
 
 
629 aa  55.5  5e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0210  C protein alpha-antigen  31.45 
 
 
730 aa  52.4  4e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  46.67 
 
 
105 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93602  predicted protein  39.76 
 
 
2146 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00915503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.73 
 
 
1047 aa  48.5  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  40.28 
 
 
105 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  40.28 
 
 
105 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.15 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.75 
 
 
2638 aa  46.2  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  29.13 
 
 
3089 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>