More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2375 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  100 
 
 
502 aa  1040  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  40.51 
 
 
586 aa  319  6e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  36.56 
 
 
535 aa  308  2e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  38.29 
 
 
499 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  34.85 
 
 
565 aa  283  4e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  40.94 
 
 
493 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  34.4 
 
 
474 aa  250  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  35.14 
 
 
466 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  30.51 
 
 
511 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  32.57 
 
 
535 aa  217  3e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  30.93 
 
 
487 aa  203  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  30.3 
 
 
523 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  28.72 
 
 
518 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.89 
 
 
509 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.29958e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  29.08 
 
 
511 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  30.48 
 
 
511 aa  157  5e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  30 
 
 
511 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  27.97 
 
 
512 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  29.88 
 
 
516 aa  154  3e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  27.85 
 
 
515 aa  153  6e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  30 
 
 
516 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  30 
 
 
516 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  28.45 
 
 
517 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  30 
 
 
516 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  28.51 
 
 
517 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  28.51 
 
 
522 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  28.51 
 
 
522 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  28.51 
 
 
522 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  28.51 
 
 
522 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  28.51 
 
 
522 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  28.33 
 
 
503 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  28.51 
 
 
517 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.91 
 
 
503 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  27.53 
 
 
513 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  29.01 
 
 
503 aa  146  8e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  29.41 
 
 
510 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  27 
 
 
486 aa  143  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  28.24 
 
 
502 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  27.64 
 
 
501 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  27.43 
 
 
501 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  27.23 
 
 
489 aa  136  7e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  27.39 
 
 
520 aa  136  1e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  27.78 
 
 
501 aa  135  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  28.32 
 
 
594 aa  135  2e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  27.39 
 
 
504 aa  135  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.74 
 
 
526 aa  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  27.29 
 
 
502 aa  135  2e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  25.95 
 
 
517 aa  132  1e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.91984e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  27.39 
 
 
476 aa  130  5e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  25.59 
 
 
501 aa  129  1e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  28.23 
 
 
480 aa  129  1e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  26.97 
 
 
504 aa  129  1e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  25.81 
 
 
501 aa  129  2e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  28.57 
 
 
505 aa  127  4e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  9.26567e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  25.35 
 
 
481 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  26.24 
 
 
512 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  25.16 
 
 
459 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.45 
 
 
489 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  28.43 
 
 
505 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.95462e-10 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  23.81 
 
 
480 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  28.75 
 
 
505 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.56 
 
 
501 aa  122  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  28.75 
 
 
505 aa  122  2e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.79 
 
 
537 aa  122  2e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  26.24 
 
 
502 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  26.08 
 
 
482 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.82 
 
 
564 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  24.51 
 
 
514 aa  120  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  26.77 
 
 
526 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  24.68 
 
 
497 aa  118  2e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  23.16 
 
 
496 aa  118  2e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  26.5 
 
 
498 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  25.73 
 
 
497 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  25.73 
 
 
497 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  23.99 
 
 
549 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  25.73 
 
 
497 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  26.35 
 
 
482 aa  117  7e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  27.7 
 
 
478 aa  116  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  25.73 
 
 
497 aa  116  1e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  26.03 
 
 
485 aa  115  2e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3265  sulfatase  26.12 
 
 
770 aa  115  2e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  25.15 
 
 
483 aa  115  2e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  25.93 
 
 
497 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  23.98 
 
 
479 aa  114  4e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  25.54 
 
 
512 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  24.12 
 
 
537 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  26.37 
 
 
511 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  25.45 
 
 
523 aa  113  7e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.1 
 
 
473 aa  113  7e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.65 
 
 
497 aa  113  7e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  24.8 
 
 
505 aa  112  2e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  25.1 
 
 
511 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  25.92 
 
 
495 aa  110  4e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  24.6 
 
 
520 aa  110  4e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  9.25232e-05 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.73 
 
 
467 aa  110  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  24.73 
 
 
502 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  25.31 
 
 
497 aa  110  8e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  25 
 
 
498 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  24.52 
 
 
515 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  26.06 
 
 
560 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>