More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2358 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  100 
 
 
499 aa  1033    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  39.92 
 
 
535 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  40.09 
 
 
586 aa  319  7.999999999999999e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  38.29 
 
 
502 aa  305  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  37.99 
 
 
474 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  37.1 
 
 
493 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  32.68 
 
 
565 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  34.8 
 
 
535 aa  259  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  33.47 
 
 
511 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  33.26 
 
 
487 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  32.29 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  32.68 
 
 
466 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  30.22 
 
 
509 aa  196  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  30.28 
 
 
505 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  29.67 
 
 
505 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  29.45 
 
 
505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  28.76 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  28.57 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  28.32 
 
 
511 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.71 
 
 
511 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  28.98 
 
 
517 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  29.74 
 
 
512 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  29.78 
 
 
510 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  27.79 
 
 
516 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  28.01 
 
 
516 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  28.76 
 
 
517 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  28.76 
 
 
522 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.79 
 
 
516 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.79 
 
 
516 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  28.76 
 
 
522 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  28.76 
 
 
522 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  28.76 
 
 
522 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  28.76 
 
 
522 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  30.24 
 
 
473 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  28.54 
 
 
517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  29.74 
 
 
515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  29.42 
 
 
503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  27.9 
 
 
513 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  28.6 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  27.79 
 
 
518 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  29.5 
 
 
526 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  28.73 
 
 
502 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  29.31 
 
 
504 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  28.38 
 
 
503 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  28.82 
 
 
501 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  29.8 
 
 
502 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  28.82 
 
 
501 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.55 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  27.31 
 
 
520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3265  sulfatase  27.91 
 
 
770 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  29.62 
 
 
504 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  28.85 
 
 
502 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  27.17 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  27.23 
 
 
564 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  27.6 
 
 
520 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  27.94 
 
 
501 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  27.8 
 
 
594 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  27.8 
 
 
501 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27.34 
 
 
496 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  26.27 
 
 
497 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  27.19 
 
 
486 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  27.58 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  28.19 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25.32 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  27.35 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  26.07 
 
 
481 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.57 
 
 
537 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  25.54 
 
 
559 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  26.53 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  27.2 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  27.5 
 
 
511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  27.04 
 
 
523 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  26.26 
 
 
552 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  26.62 
 
 
480 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.35 
 
 
497 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  25.81 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.13 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  25.37 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  25.34 
 
 
515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  25.73 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  26.7 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  26.7 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  25.49 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  26.7 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.96 
 
 
508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  26.64 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  24.58 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  26.15 
 
 
478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  25.62 
 
 
447 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  25.34 
 
 
501 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  24.26 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.42 
 
 
489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.1 
 
 
497 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  24.13 
 
 
517 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  25.41 
 
 
498 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  26.16 
 
 
493 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  24.52 
 
 
560 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  25.6 
 
 
519 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  28.86 
 
 
467 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.02 
 
 
499 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>