105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2355 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 334 aa  700    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  48.64 
 
 		 338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  46.83 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  46.22 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  43.75 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  43.75 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  43.37 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  42.5 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  41.14 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  41.12 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  45.41 
 
 		 200 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  51.94 
 
 		 147 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  27.3 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.65 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.37 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  27.06 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  29.41 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.61 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  28.27 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  26.17 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  26.52 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  27.31 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  29.5 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  26.89 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  26.89 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  26.38 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  29.63 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  25.19 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.01 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  24.81 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.42 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  25.93 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  24.89 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.03 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  25.17 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  28.97 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  24.38 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  23.14 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  21.67 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  23.97 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.77 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.24 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  24.32 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.89 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  23.29 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  28.83 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  28.83 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  28.44 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  28.44 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  22.98 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  27.56 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  30.22 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  23.97 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.1 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  22.74 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  28.95 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  23.4 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  22.47 
 
 		 396 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.81 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  21.61 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  24.85 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  24.07 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  22.51 
 
 		 482 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  26.9 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  37.29 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  27.87 
 
 		 432 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  26.94 
 
 		 346 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  30 
 
 		 439 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  31.47 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  22.67 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  23.84 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  24.19 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  25.48 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  33.9 
 
 		 451 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  24.77 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  26.63 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  24.77 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  25.93 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.29 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  20.83 
 
 		 413 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  23.77 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.29 
 
 		 414 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5474  hypothetical protein  30.28 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>